V laboratoři jsou kromě obecných zásad bezpečnosti práce dodržovány i zásady práce s biologickým materiálem, který může být zdrojem přenosu některých infekcí:
- každý vzorek krve je nutné považovat za potencionálně infekční
- žádanky ani vnější strana zkumavky nesmí být kontaminovány biologickým materiálem - toto je důvodem k odmítnutí vzorku k vyšetření
- vzorky od pacientů s přenosným virovým onemocněním či multirezistentní nozokomiální nákazou mají být viditelně označeny
- vzorky jsou přepravovány v uzavřených zkumavkách, které jsou vloženy do stojánku nebo přepravního kontejneru tak, aby během přepravy vzorku do laboratoře nemohlo dojít k rozlití, potřísnění biologickým materiálem nebo jinému znehodnocení vzorku
Laboratoř a všechny spolupracující subjekty jsou povinny tyto pokyny aplikovat a dodržovat v plném rozsahu.
Všichni zaměstnanci laboratoře dodržují Provozní řád, kde jsou podrobně popsány zásady bezpečného provozu v laboratoři a hygienicko- protiepidemiologický režim.